Příklad peptidové vazby

The Peptidová vazba je ten, ve kterém dvě molekuly aminokyselin jsou spojeny kondenzací.

Abychom lépe porozuměli peptidovým vazbám, je třeba nejprve definovat aminokyseliny:

The Aminokyseliny jsou organické molekuly krátký obsahující alespoň aminoskupina (-NH₂), zásadité povahy, a karboxylová skupina (-COOH), kyselé povahy.

Ačkoli živé bytosti syntetizují pro různé účely velmi rozmanité typy aminokyselin, nejdůležitější jsou ty, které jsou součástí bílkovin, z nichž všechny patří do třídy a-aminokyseliny.

Α-aminokyseliny se vyznačují tím, že mají kyselinu a aminoskupiny připojené ke stejnému atomu uhlíku, který se nazývá a uhlík. Dále tento uhlík α váže jako třetí substituent atom vodíku a jako čtvrtý substituent, další skupina různých velikostí a charakteristik, která odlišuje každou aminokyselinu od ostatní.

Čtvrtý substituent se nazývá Boční řetěz Aminokyseliny a ve zjednodušené formě je často reprezentována písmenem R.

Jelikož jsou čtyři substituenty α-uhlíku odlišné a kolem sebe zaujímají čtyřboké uspořádání, jsou přítomny α-aminokyseliny

optická izomerie, což je, když má molekula a alternativní forma to vypadá jako zrcadlový obraz jeho, což nakonec není stejná molekula. Těmto dvěma izomerním formám molekuly jsou přiřazena písmena D nebo L, podle toho, jak jsou v prostoru uspořádány substituenty. Všechny aminokyseliny, které jsou v bílkovinách, jsou L.

Aminokyseliny jsou klasifikovány podle chemického charakteru v Polární a apolární. Poláci se zase dělí na Neutrální a nabitá (které mohou být kyselé nebo zásadité). The Nepolární může být alifatický nebo aromatický.

Peptidy a peptidová vazba

Peptidy jsou produktem kovalentního spojení aminokyselin prostřednictvím amidových vazeb, které se tvoří pomocí kondenzace karboxylového konce jednoho a aminového konce druhého, uvolnění molekuly vody v reakce. Tato unie se nazývá peptidová vazba.

Mechanismus této reakce je uveden níže, ve kterém Aminoskupiny a karboxylové skupiny, a dochází ke kondenzaci molekul aminokyselin za vzniku peptidu.

Peptidy, jako jsou aminokyseliny a proteiny, mají na svých koncích aminoskupinu a karboxylovou skupinu bez reakce.

Chcete-li určit vzorec jednoduchého peptidu a dokonce i proteinu, stačí uvést seznam aminokyselin, které jej tvoří, počínaje tím s bezplatnou aminoskupinoua končí tím, který má bezplatnou karboxylovou skupinu.

Některé peptidy nalezené v těle jsou Vazopresin, což zvyšuje krevní tlak a zvyšuje reabsorpci vody v ledvinách; the Enkefalin, což snižuje pocit bolesti; a Oxytocin, což způsobí kontrakci dělohy.

Charakteristiky peptidových vazeb

Kondenzace aminoskupiny jedné aminokyseliny s karboxylovou skupinou jiné, probíhá ve vodném rozpouštědle, aby není to spontánní, a proto syntéza bílkovin vyžaduje přísun energie.

Peptidová vazba, jako v každé amidové vazbě, představuje rezonanci mezi dvěma extrémními formami: neutrální forma, s jednoduchou vazbou spojující karbonylový uhlík první aminokyseliny a amino dusík druhé (C-N), a forma s oddělením poplatků ve kterém jsou dva atomy spojeny dvojnou vazbou (C = N). Ve skutečnosti peptidová vazba nepřijímá žádnou ze dvou extrémních situací, ale je rezonančním hybridem obou.

Je tu hovor Peptidová rovina, skládající se z všechny atomy zapojené do peptidové vazby, které spojují dvě počáteční aminokyseliny. Na jedné straně atomy dusíku a vodíku s příslušným uhlíkem α v první aminokyselině. Na druhé straně je uhlík α jiné aminokyseliny s kyslíkem a uhlíkem karbonylové skupiny.

Rozdíly mezi peptidy a proteiny

The peptidy mají nízký počet aminokyselin, který se pohybuje od dvou do několika desítek z nich, a jejich konformace v řešení se stává flexibilní.

The malé bílkoviny, strukturně blízké velkým peptidům, mají a definovaná konformace a mnohem méně flexibilní.

Existují proteiny, které mají podobně jako peptidy neuspořádanou a pružnou konformaci, ale jsou v pořadí, když interagují s jinými makromolekulami v buňce.

20 příkladů aminokyselin, které se účastní vazby peptidů

1. Wisteria
2. K dívce
3. Valine
4. Leucin
5. Isoleucin
6. Prolin
7. Methionin
8. Fenylalanin
9. Tyrosin
10. Tryptofan
11. Serine
12. Threonin
13. Cystein
14. Asparagin
15. Glutamin
16. Kyselina asparagová
17. Kyselina glutamová
18. Lysin
19. Arginin
20. Histidin