Primjer peptidne veze

The Peptidna veza je onaj u kojem dvije molekule aminokiselina spajaju se kondenzacijom.

Da bi se bolje razumjele peptidne veze, prvo se moraju definirati aminokiseline:

The Aminokiseline su organske molekule kratko sadrži najmanje amino skupina (-NH₂), alkalne prirode, i karboksilna skupina (-COOH), kiselog karaktera.

Iako živa bića sintetiziraju, u različite svrhe, vrlo raznolike vrste aminokiselina, najvažnije su one koje su dio proteina, koji svi pripadaju klasi a-aminokiseline.

A-aminokiseline karakterizirane su time što su kiselina i aminokiseline povezane s istim atomom ugljika, nazvanim α ugljik. Nadalje, ovaj α ugljik veže kao treći supstituent atom vodika i kao četvrti supstituent, dodatna skupina različitih veličina i karakteristika koja razlikuje svaku aminokiselinu od drugi.

Četvrti supstituent se naziva Bočni lanac Aminokiselina i često je predstavljen u pojednostavljenom obliku slovom R.

Kako su četiri supstituenta α-ugljika različita i usvajaju tetraedarski raspored oko sebe, prisutne su α-aminokiseline

optička izomerija, a to je kada molekula ima a zamjenski oblik koji izgleda kao zrcalna slika njegova, koja na kraju nije jednaka molekula. Ova dva izomerna oblika molekule imaju slova D ili L, ovisno o tome kako su supstituenti raspoređeni u prostoru. Sve aminokiseline koje se nalaze u proteinima su L.

Aminokiseline su klasificirane prema kemijskim svojstvima u Polar i Apolar. Polari su pak podijeljeni na Neutralno i naplaćeno (koja može biti kisela ili bazična). The Nepolarni mogu biti alifatski ili aromatični.

Peptidi i peptidna veza

Peptidi su proizvod kovalentnog spajanja aminokiselina kroz amidne veze, tvoreći kondenzacija karboksilnog kraja jednog i amino kraja drugog, oslobađajući molekulu vode u reakcija. Taj se spoj naziva Peptidna veza.

Mehanizam ove reakcije predstavljen je u nastavku, u kojem Amino i karboksilne skupine, a dolazi do kondenzacije molekula aminokiseline koja stvara peptid.

Peptidi, poput aminokiselina i proteina, na svojim krajevima imaju amino skupinu i karboksilnu skupinu a da ne reagira.

Da biste odredili formulu jednostavnog peptida, pa čak i proteina, dovoljno je navesti aminokiseline koje ga čine, počevši od one s besplatnom Amino grupom, a završava onim sa slobodnom karboksilnom skupinom.

Neki peptidi koji se nalaze u tijelu su Vazopresin, koji podiže krvni tlak i povećava reapsorpciju vode u bubrezima; the Enkefalin, koji smanjuje osjećaj boli; i Oksitocin, zbog čega se maternica skuplja.

Karakteristike peptidne veze

Kondenzacija amino skupine jedne aminokiseline s karboksilom druge, odvija se u vodenom otapalu, tako da nije spontano, te stoga sinteza proteina zahtijeva opskrbu energijom.

Peptidna veza, kao u bilo kojoj amidnoj vezi, predstavlja rezonanciju između dva ekstremna oblika: neutralni oblik, s jednostrukom vezom koja spaja karbonilni ugljik prve aminokiseline i amino dušik druge (C-N), i oblik s odvajanjem naboja u kojem su dva atoma povezana dvostrukom vezom (C = N). U stvarnosti, peptidna veza ne prihvaća niti jednu od dvije ekstremne situacije, već je rezonantni hibrid obje.

Tu je poziv Peptidni avion, koja se sastoji od svi atomi uključeni u peptidnu vezu, koji se pridružuju dvjema početnim aminokiselinama. S jedne strane, atomi Dušika i Vodika, s njihovim ugljikom α u prvoj aminokiselini. S druge strane, ugljik α druge aminokiseline, s kisikom i ugljikom karbonilne skupine.

Razlike između peptida i proteina

The peptidi imaju nizak broj aminokiselina, koja se kreće od dva do nekoliko desetaka, a njihova konformacija u otopini postaje fleksibilna.

The mali proteini, strukturno bliski velikim peptidima, imaju a definirana konformacija i mnogo manje fleksibilna.

Postoje proteini koji poput peptida imaju neuređenu i fleksibilnu konformaciju, ali takav redoslijed utječu u interakciju s drugim makromolekulama u stanici.

20 primjera aminokiselina koje sudjeluju u peptidnom vezivanju

1. Glicinija
2. Djevojci
3. Valine
4. Leucin
5. Izoleucin
6. Prolin
7. Metionin
8. Fenilalanin
9. Tirozin
10. Triptofan
11. Serine
12. Treonin
13. Cistein
14. Asparagin
15. Glutamin
16. Asparaginska kiselina
17. Glutaminska kiselina
18. Lizin
19. Arginin
20. Histidin