כל האורגניזמים הביולוגיים ממוקמים בתוך מערכות אשר קשורות זו בזו ברמות שונות. לזה קוראים לזה ארגון אקולוגי, הכוללת את הרמות הבאות:
אִישִׁי. הידוע גם בשם רמת האורגניזם, זוהי רמה מכרעת עבור האורגניזם את היכולת להתרבות. כל אדם חייב להיות מותאם לסביבתו, ולקיים אינטראקציה בדרכים שונות עם אחרים (הדדיות, תחרות, רבייה, טורף). כמו כן, ניתן לחלק כל אחד מהאורגניזמים הללו לשלבים שונים (מחזור חיים): לידה, גדילה, בגרות, הזדקנות, מוות.
אוּכְלוֹסִיָה. אוכלוסיה אקולוגית נקראת קבוצת אורגניזמים מאותו המין או פרטים השוכנים באותו אזור גיאוגרפי. דרכי ההתייחסות אחד לשני הן: הדדיות, יְכוֹלֶת, טְפִילוּת, טרף ורבייה מינית (הזדווגות). לדוגמא: קבוצת ג'ירפות שגרה באותו מקום.
קהילה. קהילה היא קבוצה של אוכלוסיות שחולקות את אותו אתר לפרק זמן מסוים. מינים יכולים להתקיים יחד בעלי חיים, ירקות או שניהם. לדוגמא: חתולים הם קהילה המכילה מינים שונים כגון פומות, נמרים, חתולי בר.
מערכת אקולוגית. מערכת אקולוגית היא מרחב שבו אורגניזמים חיים שונים מתקשרים זה עם זה (צמחים או בעלי חיים). בניגוד לקהילה, במערכת האקולוגית האורגניזמים המרכיבים אותה מקיימים אינטראקציה המייצרים אנרגיה ומחזור מזון. מערכת אקולוגית היא ויסות עצמי ומספקת את עצמה, כלומר יש לה את המשאבים להיות עצמאיים ממערכות אקולוגיות אחרות ולספק את המינים שלה. לרמה זו יש מרכיב אביוטי, כלומר, הוא אינו חי (למשל: חמצן, מים, פחמן דו חמצני, חנקן) ועוד ביוטיק, כלומר שיש לו חיים (למשל: בעלי חיים ו ירקות).
ביומה. ביומה היא קבוצה של מערכות אקולוגיות המציגים קווי דמיון זה לזה בשניהם רכיבים אביוטיים מה ביוטיקה. לדוגמא: חלק של א יַבֶּשֶׁת שיש בהם אקלים עם מאפיינים דומים ומינים דומים.
ביוספירה. הביוספרה היא מערכת ביומים המציגה הבדלים ביחס זה לזה, אך גם קווי דמיון מסוימים. כדור הארץ נחשב כביוספרה נהדרת, הכוללת את האקלים, האוקיינוסים והיבשות השונים של כדור הארץ. כמו כן הביוספרה נחשבת לאטמוספירה התחתונה של כדור הארץ.