Peptīdu obligāciju piemērs
Ķīmija / / July 04, 2021
The Peptīdu obligācija ir tā, kurā divas aminoskābju molekulas ir savienotas ar kondensāciju.
Lai labāk izprastu peptīdu saites, vispirms jānosaka aminoskābes:
The Aminoskābes ir organiskas molekulas īss, kas satur vismaz aminogrupa (-NH2), sārmains, un karboksilgrupa (-COOH), skāba rakstura.
Lai gan dzīvās būtnes dažādiem mērķiem sintezē ļoti dažādus aminoskābju veidus, vissvarīgākie ir tie, kas ir daļa no olbaltumvielām, kas visi pieder pie α-aminoskābes.
Α-aminoskābēm raksturīga tā, ka skābju un aminoskābju grupas ir saistītas ar vienu un to pašu oglekļa atomu, ko sauc par oglekli. Turklāt šis α ogleklis kā trešais aizvietotājs saista ūdeņraža atomu un kā ceturto aizvietotājs, dažāda lieluma un īpašību papildu grupa, kas katru aminoskābi atšķir no citi.
Tiek saukts ceturtais aizstājējs Sānu ķēde Aminoskābe, un to vienkāršotā formā bieži attēlo R burts.
Tā kā četri α-oglekļa aizstājēji ir atšķirīgi un ap to izveido tetraedrisku izkārtojumu, klātesošās α-aminoskābes optiskais izomērijs, kas ir tad, kad molekulai ir a
aizstājēja forma kas izskatās kā spoguļattēls viņa, kas galu galā nav vienāda molekula. Šīm divām molekulas izomēra formām tiek piešķirti burti D vai L atkarībā no tā, kā aizvietotāji ir izvietoti telpā. Visas aminoskābes, kas atrodas olbaltumvielās, ir L.Aminoskābes klasificē pēc to ķīmiskās īpašības Polārā un Apolārā. Polāri savukārt ir sadalīti Neitrāls un uzlādēts (kas var būt skābs vai bāzisks). The Nepolārs var būt alifātisks vai aromātisks.
Peptīdi un peptīdu saite
Peptīdi ir aminoskābju kovalentās savienošanās rezultāts caur amīdu saitēm, veidojoties - viena un otra amino karboksilgrupas kondensācija, izdalot ūdens molekulu reakcija. Šo savienību sauc par peptīdu obligāciju.
Šīs reakcijas mehānisms ir parādīts zemāk, kurā Aminogrupas un karboksilgrupas, un Aminoskābes molekulu kondensācija notiek, veidojot peptīdu.
Peptīdi, piemēram, aminoskābes un olbaltumvielas, galos ir aminogrupa un karboksilgrupa nereaģējot.
Lai norādītu vienkārša peptīda un pat olbaltumvielu formulu, pietiek uzskaitīt aminoskābes, kas to veido, sākot ar vienu ar bezmaksas Amino grupu, un beidzot ar vienu ar brīvo karboksilgrupu.
Daži peptīdi, kas atrodami organismā, ir Vasopresīns, kas paaugstina asinsspiedienu un palielina ūdens reabsorbciju nierēs; Enkefalīns, kas samazina sāpju sajūtas; un Oksitocīns, kas izraisa dzemdes saraušanos.
Peptīdu obligāciju raksturojums
Vienas aminoskābes aminogrupas kondensācija ar citas aminoskābes karboksilu, notiek ūdens šķīdinātājā, tā ka tas nav spontāns, un tāpēc olbaltumvielu sintēze prasa enerģijas piegādi.
Peptīdu saite, tāpat kā jebkura amīda saite, rada rezonansi starp divām galējām formām: neitrālā formaar vienu saiti, kas savieno pirmās aminoskābes karboniloglekli un otrās (C-N) aminoskābi, un forma ar maksu atdalīšanu kurā abi atomi ir saistīti ar dubultu saiti (C = N). Patiesībā peptīdu saite nepieņem nevienu no abām galējām situācijām, bet ir abu rezonanses hibrīds.
Ir zvans Peptīdu lidmašīna, kas sastāv no visi peptīdu saitē iesaistītie atomi, kas savienojas ar divām sākotnējām aminoskābēm. No vienas puses, slāpekļa un ūdeņraža atomi ar attiecīgajiem oglekļa atomiem pirmajā aminoskābē. No otras puses, otras aminoskābes ogleklis α ar karbonilgrupas skābekli un oglekli.
Atšķirības starp peptīdiem un olbaltumvielām
The peptīdos ir maz aminoskābju, kas svārstās no diviem līdz dažiem desmitiem no tiem, un to konformācija šķīdumā kļūst elastīga.
The mazas olbaltumvielas, strukturāli tuvu lieliem peptīdiem, ir a noteikta konformācija un daudz mazāk elastīga.
Ir olbaltumvielas, kurām, tāpat kā peptīdiem, ir nesakārtota un elastīga konformācija, bet šāda kārtība, kad tās mijiedarbojas ar citām šūnā esošajām makromolekulām.
20 aminoskābju piemēri, kas piedalās peptīdu savienošanā
- Visterija
- Meitenei
- Valīna
- Leicīns
- Izoleicīns
- Prolīna
- Metionīns
- Fenilalanīns
- Tirozīns
- Triptofāns
- Serine
- Treonīns
- Cisteīns
- Asparagīns
- Glutamīns
- Asparagīnskābe
- Glutamīnskābe
- Lizīns
- Arginīns
- Histidīns