Príklad peptidovej väzby

The Peptidová väzba je ten, v ktorom dve molekuly aminokyselín sú spojené kondenzáciou.

Pre lepšie pochopenie peptidových väzieb je potrebné najskôr definovať aminokyseliny:

The Aminokyseliny sú organické molekuly krátke obsahujúce minimálne aminoskupina (-NH₂), alkalickej povahy, a karboxylová skupina (-COOH), kyslého charakteru.

Aj keď živé bytosti syntetizujú na rôzne účely veľmi rozmanité typy aminokyselín, najdôležitejšie sú tie, ktoré sú súčasťou bielkovín, všetky patria do triedy a-aminokyseliny.

A-aminokyseliny sa vyznačujú tým, že majú kyselinu a aminoskupiny pripojené k rovnakému atómu uhlíka, ktorý sa nazýva a uhlík. Ďalej tento a uhlík viaže ako tretí substituent atóm vodíka a ako štvrtý substituent substituent, ďalšia skupina rôznej veľkosti a charakteristík, ktorá odlišuje každú aminokyselinu od iné.

Štvrtý substituent sa nazýva Bočná reťaz aminokyseliny a je často v zjednodušenej forme reprezentovaný písmenom R.

Pretože štyri substituenty a-uhlíka sú rôzne a okolo seba prijímajú štvorboké usporiadanie, sú prítomné a-aminokyseliny

optická izoméria, čo je, keď má molekula a alternatívna forma to vyzerá ako a Zrkadlový obraz ktorý nakoniec nie je rovnakou molekulou. Týmto dvom izomérnym formám molekuly sú priradené písmená D alebo L, v závislosti od toho, ako sú substituenty usporiadané v priestore. Všetky aminokyseliny, ktoré sú v bielkovinách, sú L.

Aminokyseliny sú klasifikované podľa chemického charakteru v Polárny a apolárny. Polári sa zasa delia na Neutrálne a spoplatnené (ktoré môžu byť kyslé alebo zásadité). The Nepolárne môžu byť alifatické alebo aromatické.

Peptidy a peptidová väzba

Peptidy sú produktom kovalentného spojenia aminokyselín prostredníctvom amidových väzieb, ktoré vznikajú pomocou kondenzácia karboxylového konca jedného a amino konca druhého, uvoľnenie molekuly vody v reakcia. Táto únia sa nazýva peptidová väzba.

Mechanizmus tejto reakcie je uvedený nižšie, v ktorom Aminoskupiny a karboxylové skupiny, a dochádza ku kondenzácii molekúl aminokyselín za vzniku peptidu.

Peptidy, ako sú aminokyseliny a bielkoviny, majú na svojich koncoch aminoskupinu a karboxylovú skupinu bez reakcie.

Ak chcete určiť vzorec jednoduchého peptidu a dokonca aj proteínu, stačí uviesť zoznam aminokyselín, ktoré ho tvoria, počnúc tým s bezplatnou aminoskupinou, a končiac tým s jeho bezplatnou karboxylovou skupinou.

Niektoré peptidy nachádzajúce sa v tele sú Vazopresín, ktorý zvyšuje krvný tlak a zvyšuje reabsorpciu vody v obličkách; the Enkefalín, čo zmierňuje pocit bolesti; a Oxytocín, ktorá spôsobuje stiahnutie maternice.

Charakteristiky peptidových väzieb

Kondenzácia aminoskupiny jednej aminokyseliny s karboxylovou skupinou druhej, prebieha vo vodnom rozpúšťadle, aby tak nie je to spontánne, a preto syntéza bielkovín vyžaduje prísun energie.

Peptidová väzba, ako v každej amidovej väzbe, predstavuje rezonanciu medzi dvoma extrémnymi formami: neutrálna forma, s jednoduchou väzbou spájajúcou karbonylový uhlík prvej aminokyseliny a amínový dusík druhej (C-N), a formulár s oddelením poplatkov v ktorom sú dva atómy spojené dvojitou väzbou (C = N). V skutočnosti peptidová väzba neprijíma ani jednu z dvoch extrémnych situácií, ale je rezonančným hybridom oboch.

Je tu hovor Peptidová rovina, skladajúci sa z všetky atómy zapojené do peptidovej väzby, ktoré spájajú dve počiatočné aminokyseliny. Na jednej strane atómy dusíka a vodíka s príslušným uhlíkom α v prvej aminokyseline. Na druhej strane uhlík α druhej aminokyseliny, s kyslíkom a uhlík karbonylovej skupiny.

Rozdiely medzi peptidmi a bielkovinami

The peptidy majú nízky počet aminokyselín, ktoré sa pohybujú od dvoch do niekoľkých desiatok z nich a ich konformácia v riešení sa stáva flexibilnou.

The malé bielkoviny, štruktúrne blízke veľkým peptidom, majú a definovaná konformácia a oveľa menej flexibilná.

Existujú proteíny, ktoré majú podobne ako peptidy neusporiadanú a pružnú konformáciu, ale sú usporiadané pri interakcii s inými makromolekulami v bunke.

20 príkladov aminokyselín, ktoré sa podieľajú na väzbe peptidov

1. Wisteria
2. Dievčaťu
3. Valine
4. Leucín
5. Izoleucín
6. Prolín
7. Metionín
8. Fenylalanín
9. Tyrozín
10. Tryptofán
11. Serín
12. Treonín
13. Cysteín
14. Asparagín
15. Glutamín
16. Kyselina asparágová
17. Kyselina glutámová
18. Lyzín
19. Arginín
20. Histidín