Primer peptidne vezi

The Peptidna vezava je tista, v kateri dve molekuli aminokislin se združita s kondenzacijo.

Za boljše razumevanje peptidnih vezi je treba najprej opredeliti aminokisline:

The Aminokisline so organske molekule kratek vsebuje vsaj amino skupina (-NH₂), alkalne narave, in karboksilna skupina (-COOH), kislega značaja.

Čeprav živa bitja sintetizirajo za različne namene zelo raznolike vrste aminokislin, so najpomembnejše tiste, ki so del beljakovin, ki vse spadajo v razred α-aminokisline.

Za α-aminokisline je značilno, da imajo kislino in amino skupine vezane na isti atom ogljika, imenovan α ogljik. Poleg tega se ta α ogljik kot tretji substituent veže na atom vodika in kot četrti substituent, dodatna skupina različnih velikosti in značilnosti, ki razlikuje vsako aminokislino od drugi.

Četrti substituent se imenuje Stranska veriga Aminokislina in je v poenostavljeni obliki pogosto predstavljena s črko R.

Ker so štirje substituenti α-ogljika različni in sprejemajo tetraedrski razpored okoli njega, so prisotne α-aminokisline

optična izomerija, to je, ko ima molekula a nadomestna oblika ki izgleda kot zrcalna slika njegov, ki na koncu ni enakovredna molekula. Ti dve izomerni obliki molekule imata črki D ali L, odvisno od tega, kako so substituenti razporejeni v prostoru. Vse aminokisline, ki so v beljakovinah, so L.

Aminokisline so razvrščene glede na njihov kemijski značaj v Polar in Apolar. Polarje pa delimo na Nevtralno in zaračunano (ki je lahko kisla ali bazična). The Nepolarni so lahko alifatski ali aromatični.

Peptidi in peptidna vez

Peptidi so produkt kovalentne zveze aminokislin skozi amidne vezi, ki jih tvorijo kondenzacija karboksilnega konca enega in amino konca drugega, pri čemer se sprosti molekula vode v reakcija. Ta zveza se imenuje peptidna vez.

Mehanizem te reakcije je predstavljen spodaj, v katerem je Amino in karboksilne skupine, in pride do kondenzacije molekul aminokisline, ki tvori peptid.

Peptidi, kot so aminokisline in beljakovine, imajo na svojih koncih amino skupino in karboksilno skupino ne da bi reagirali.

Če želite določiti formulo preprostega peptida in celo beljakovine, je dovolj našteti aminokisline, ki ga sestavljajo, začenši s tistim z brezplačno skupino Amino, in konča s tistim s svojo prosto karboksilno skupino.

Nekateri peptidi, ki jih najdemo v telesu, so Vazopresin, ki zviša krvni tlak in poveča reabsorpcijo vode v ledvicah; Enkefalin, ki zmanjša občutek bolečine; in Oksitocin, zaradi česar se maternica krči.

Značilnosti peptidnih vezi

Kondenzacija amino skupine ene aminokisline s karboksilom druge, poteka v vodnem topilu, tako da ni spontano, zato sinteza beljakovin zahteva zalogo energije.

Peptidna vez, kot pri kateri koli amidni vezi, predstavlja resonanco med dvema skrajnima oblikama: nevtralna oblikaz enojno vezjo, ki povezuje karbonilni ogljik prve aminokisline in amino dušik druge (C-N), in obrazec z ločitvijo nabojev v katerem sta oba atoma povezana z dvojno vezjo (C = N). V resnici peptidna vez ne sprejme nobene od obeh skrajnih situacij, je pa resonančni hibrid obeh.

Tam je klic Peptidna ravnina, ki jo sestavljajo vsi atomi, ki sodelujejo v peptidni vezi, ki se pridružijo dvema začetnima aminokislinama. Po eni strani atoma dušika in vodika s pripadajočim ogljikom α v prvi aminokislini. Po drugi strani pa ogljik α druge aminokisline s kisikom in ogljikom karbonilne skupine.

Razlike med peptidi in beljakovinami

The peptidi imajo majhno število aminokislin, ki se giblje od dveh do nekaj ducatov, njihova konformacija v raztopini pa postane prožna.

The majhne beljakovine, strukturno blizu velikim peptidom, imajo a definirana konformacija in veliko manj prilagodljiva.

Obstajajo beljakovine, ki imajo tako kot peptidi neurejeno in fleksibilno konformacijo, vendar ta vrstni red medsebojno delujejo z drugimi makromolekulami v celici.

20 primerov aminokislin, ki sodelujejo pri peptidnem lepljenju

1. Glicinija
2. Deklici
3. Valine
4. Levcin
5. Izolevcin
6. Prolin
7. Metionin
8. Fenilalanin
9. Tirozin
10. Triptofan
11. Serine
12. Treonin
13. Cistein
14. Asparagin
15. Glutamin
16. Asparaginska kislina
17. Glutaminska kislina
18. Lizin
19. Arginin
20. Histidin