ตัวอย่างพันธะเปปไทด์

พันธะเปปไทด์ เป็นที่หนึ่งที่ โมเลกุลของกรดอะมิโน 2 ตัวมารวมกันโดยการควบแน่น.

เพื่อให้เข้าใจพันธะเปปไทด์ได้ดีขึ้น อันดับแรกต้องกำหนดกรดอะมิโน:

กรดอะมิโนเป็นโมเลกุลอินทรีย์ สั้นที่มีอย่างน้อย หมู่อะมิโน (-NH₂), เป็นด่างในธรรมชาติ, และหมู่คาร์บอกซิล (-COOH), มีลักษณะเป็นกรด

แม้ว่าสิ่งมีชีวิตจะสังเคราะห์ขึ้นเพื่อจุดประสงค์ที่แตกต่างกัน กรดอะมิโนหลากหลายชนิด สิ่งที่สำคัญที่สุดคือกรดอะมิโนเหล่านั้น เป็นส่วนหนึ่งของโปรตีน ซึ่งทั้งหมดอยู่ในชั้นเรียนของ กรดอะมิโน.

กรด α-amino มีลักษณะเฉพาะโดยมีกรดและหมู่อะมิโนติดอยู่กับอะตอมของคาร์บอนเดียวกัน เรียกว่า α Carbon นอกจากนี้ คาร์บอน α นี้จับกับอะตอมไฮโดรเจนในฐานะที่เป็นหมู่แทนที่ที่สาม และในฐานะที่เป็นอะตอมที่สี่ สารทดแทน กลุ่มเพิ่มเติมที่มีขนาดและลักษณะที่หลากหลาย ซึ่งแยกความแตกต่างของกรดอะมิโนแต่ละชนิดออกจาก คนอื่น ๆ

หมู่แทนที่ที่สี่เรียกว่า โซ่ข้าง กรดอะมิโน และมักจะแสดงในรูปแบบย่อด้วยตัวอักษร R

เนื่องจากหมู่แทนที่ทั้งสี่ของ α-carbon นั้นแตกต่างกัน และใช้การจัดเรียงแบบจัตุรมุขรอบๆ ตัวมัน กรด α-amino จึงมี ออปติคัล isomerismซึ่งก็คือเมื่อโมเลกุลมี a รูปแบบอื่น

ที่ดูเหมือน a ภาพสะท้อนในกระจก ของเขาซึ่งในที่สุดแล้วโมเลกุลก็ไม่เท่ากัน รูปแบบไอโซเมอร์ทั้งสองนี้ของโมเลกุลถูกกำหนดให้เป็นตัวอักษร D หรือ L ขึ้นอยู่กับวิธีการจัดเรียงหมู่แทนที่ในอวกาศ กรดอะมิโนทั้งหมดที่อยู่ในโปรตีนคือ L.

กรดอะมิโนจำแนกตามลักษณะทางเคมีใน โพลาร์และโพลาร์. ขั้วโลกจะแบ่งออกเป็น divided เป็นกลางและมีประจุ (ซึ่งอาจเป็นกรดหรือด่างก็ได้) ไม่มีขั้วอาจเป็นอะลิฟาติกหรืออะโรมาติก.

เปปไทด์และพันธะเปปไทด์

เปปไทด์เป็นผลคูณของการรวมตัวของโควาเลนต์ของกรดอะมิโนผ่านพันธะเอไมด์ซึ่งเกิดขึ้นโดย การควบแน่นของปลายคาร์บอกซิลของด้านหนึ่งและปลายอะมิโนของอีกด้านหนึ่ง ปล่อยโมเลกุลน้ำออกมาใน ปฏิกิริยา. สหภาพนี้เรียกว่าเปปไทด์บอนด์

กลไกของปฏิกิริยานี้แสดงไว้ด้านล่าง โดยที่ กลุ่มอะมิโนและคาร์บอกซิล และการควบแน่นของโมเลกุลกรดอะมิโนเกิดขึ้นเป็นเปปไทด์

เปปไทด์ เช่น กรดอะมิโนและโปรตีน มีหมู่อะมิโนและหมู่คาร์บอกซิลอยู่ที่ปลาย โดยไม่เกิดปฏิกิริยา

เพื่อระบุสูตรของเปปไทด์อย่างง่ายและแม้แต่โปรตีนก็เพียงพอที่จะระบุกรดอะมิโนที่ประกอบเป็น เริ่มด้วยกลุ่มอะมิโนฟรี freeและลงท้ายด้วยกลุ่มคาร์บอกซิลอิสระ

เปปไทด์บางชนิดที่พบในร่างกายคือ วาโซเพรสซินซึ่งเพิ่มความดันโลหิตและเพิ่มการดูดซึมน้ำในไต เอนเคฟาลินซึ่งช่วยลดความรู้สึกเจ็บปวด และ ออกซิโตซินซึ่งทำให้มดลูกหดตัว

ลักษณะของพันธะเปปไทด์

การควบแน่นของหมู่อะมิโนของกรดอะมิโนตัวหนึ่งกับคาร์บอกซิลของอีกตัวหนึ่ง เกิดขึ้นในตัวทำละลายที่เป็นน้ำ, ดังนั้น มันไม่เกิดขึ้นเองดังนั้นการสังเคราะห์โปรตีนจึงต้องการพลังงาน

พันธะเปปไทด์ เช่นเดียวกับพันธะเอไมด์ใดๆ แสดงการสะท้อนระหว่างสองรูปแบบสุดขั้ว: รูปแบบที่เป็นกลางด้วยพันธะเดี่ยวที่เชื่อมคาร์บอนิลคาร์บอนของกรดอะมิโนตัวแรกกับอะมิโนไนโตรเจนของกรดอะมิโนที่สอง (C-N) และ แบบฟอร์มแยกค่าธรรมเนียม โดยที่อะตอมทั้งสองนั้นเชื่อมโยงกันด้วยพันธะคู่ (C = N) ในความเป็นจริง พันธะเปปไทด์ไม่ได้ใช้สถานการณ์ที่รุนแรงอย่างใดอย่างหนึ่งในสองสถานการณ์ แต่เป็นลูกผสมเรโซแนนซ์ของทั้งสองอย่าง

มีสายเรียกเข้า เครื่องบินเปปไทด์, ซึ่งประกอบด้วย อะตอมทั้งหมดที่เกี่ยวข้องกับพันธะเปปไทด์ซึ่งรวมกรดอะมิโนตั้งต้นสองตัว two. ในอีกด้านหนึ่ง อะตอมของไนโตรเจนและไฮโดรเจน โดยมีคาร์บอน α ตามลำดับในกรดอะมิโนตัวแรก อีกด้านหนึ่งคือคาร์บอน α ของกรดอะมิโนอีกตัวหนึ่ง โดยมีออกซิเจนและคาร์บอนของกลุ่มคาร์บอนิล

ความแตกต่างระหว่างเปปไทด์และโปรตีน

เปปไทด์มีกรดอะมิโนจำนวนน้อยซึ่งมีตั้งแต่สองถึงสองสามโหล และการจัดรูปแบบในสารละลายจะยืดหยุ่นได้

โปรตีนขนาดเล็ก, โครงสร้างใกล้เคียงกับเปปไทด์ขนาดใหญ่, มี รูปแบบที่กำหนดไว้และมีความยืดหยุ่นน้อยกว่ามาก.

มีโปรตีนที่เหมือนกับเปปไทด์ ซึ่งมีโครงสร้างที่ไม่เป็นระเบียบและยืดหยุ่นได้ แต่เมื่อพวกมันมีปฏิสัมพันธ์กับโมเลกุลขนาดใหญ่อื่นๆ ในเซลล์

20 ตัวอย่างกรดอะมิโนที่มีส่วนช่วยในการสร้างพันธะเปปไทด์

1. วิสทีเรีย
2. ถึงหญิงสาว
3. วาลีน
4. ลิวซีน
5. ไอโซลิวซีน
6. โพรลีน
7. เมไทโอนีน
8. ฟีนิลอะลานีน
9. ไทโรซีน
10. ทริปโตเฟน
11. ซีรีน
12. ธรีโอนีน
13. ซีสเตอีน
14. หน่อไม้ฝรั่ง
15. กลูตามีน
16. กรดแอสปาร์ติก
17. กรดกลูตามิก
18. ไลซีน
19. อาร์จินีน
20. ฮิสติดีน