Пример пептидной связи

В Пептидная связь тот, в котором две молекулы аминокислот соединяются путем конденсации.

Чтобы лучше понять пептидные связи, сначала необходимо определить аминокислоты:

В Аминокислоты - это органические молекулы короткий, содержащий как минимум аминогруппа (-NH₂)щелочная по природе, и карбоксильная группа (-COOH)кислый характер.

Хотя живые существа синтезируют для разных целей очень разные типы аминокислот, наиболее важными из них являются те, которые входят в состав белков, все они принадлежат к классу α-аминокислоты.

Α-аминокислоты характеризуются тем, что кислотные и аминогруппы присоединены к одному и тому же атому углерода, называемому α углеродом. Кроме того, этот α-углерод связывает в качестве третьего заместителя с атомом водорода и в качестве четвертого заместителя заместитель, дополнительная группа различного размера и характеристик, которая отличает каждую аминокислоту от другие.

Четвертый заместитель называется Боковая цепь аминокислоты и часто в упрощенном виде обозначается буквой R.

Поскольку четыре заместителя α-углерода различны и имеют тетраэдрическое расположение вокруг него, присутствующие α-аминокислоты оптическая изомерия, когда молекула имеет альтернативная форма это похоже на зеркальное отражение его, который, в конце концов, не является равной молекулой. Эти две изомерные формы молекулы обозначаются буквами D или L, в зависимости от того, как заместители расположены в пространстве. Все аминокислоты, входящие в состав белков, относятся к L.

Аминокислоты классифицируются в соответствии с их химическим характером в Полярный и аполярный. Полярники в свою очередь делятся на Нейтральный и заряженный (который может быть кислотным или основным). В Неполярные могут быть алифатическими или ароматическими.

Пептиды и пептидная связь

Пептиды являются продуктом ковалентного объединения аминокислот через амидные связи, образующегося за счет конденсация карбоксильного конца одного и амино-конца другого с высвобождением молекулы воды в реакция. Этот союз называется Peptide Bond.

Механизм этой реакции представлен ниже, в котором Амино- и карбоксильные группы, и происходит конденсация молекул аминокислот с образованием пептида.

Пептиды, такие как аминокислоты и белки, имеют на концах аминогруппу и карбоксильную группу не реагируя.

Чтобы указать формулу простого пептида и даже белка, достаточно перечислить входящие в его состав аминокислоты, начиная с той, у которой есть бесплатная аминогруппа, и заканчивая тем, у которого есть свободная карбоксильная группа.

Некоторые пептиды, обнаруженные в организме, являются Вазопрессин, который повышает артериальное давление и увеличивает реабсорбцию воды в почках; в Энкефалин, что снижает болевые ощущения; и Окситоцин, что заставляет матку сокращаться.

Характеристики пептидной связи

Конденсация аминогруппы одной аминокислоты с карбоксилом другой, проходит в водном растворителе, чтобы это не спонтанно, поэтому для синтеза белка требуется запас энергии.

Пептидная связь, как и любая амидная связь, представляет собой резонанс между двумя крайними формами: нейтральная форма, с одинарной связью, соединяющей карбонильный углерод первой аминокислоты и аминный азот второй (C-N), и бланк с разделением зарядов в котором два атома связаны двойной связью (C = N). В действительности пептидная связь не допускает ни одной из двух крайних ситуаций, но представляет собой резонансный гибрид обоих.

Есть звонок Пептидный самолет, состоящий из все атомы, участвующие в пептидной связи, которые присоединяются к двум исходным аминокислотам. С одной стороны, атомы азота и водорода с их соответствующим углеродом α в первой аминокислоте. С другой стороны, углерод α другой аминокислоты с кислородом и углеродом карбонильной группы.

Различия между пептидами и белками

В пептиды имеют низкое количество аминокислот, которых насчитывается от двух до нескольких десятков, и их конформация в растворе становится гибкой.

В маленькие белки, структурно близкие к крупным пептидам, имеют определенное телосложение и гораздо менее гибкое.

Есть белки, которые, как и пептиды, имеют неупорядоченную и гибкую конформацию, но в том же порядке, когда они взаимодействуют с другими макромолекулами в клетке.

20 примеров аминокислот, участвующих в связывании пептидов

1. Глициния
2. Девушке
3. Валин
4. Лейцин
5. Изолейцин
6. Пролин
7. Метионин
8. Фенилаланин
9. Тирозин
10. Триптофан
11. Серин
12. Треонин
13. Цистеин
14. Аспарагин
15. Глутамин
16. Аспарагиновая кислота
17. Глютаминовая кислота
18. Лизин
19. Аргинин
20. Гистидин